『Обложка, разработанная Сонди, была представлена ​​в журнале Cell』Раскрываем секреты микробов ризосферы сельскохозяйственных культур: знакомимся с двумя основными библиотеками генов, CRBC и CRVC!!

Том 188, выпуск 9p2521-2539.e2201 мая 2025 г.

Руй Дай1,2,3,4,11 ∙ Цзинъин Чжан2,3,11 ∙ Фан Лю1,11 ∙ Хаоран Сюй1,3,4 ∙ Цзин-Мэй Цянь1,3,4 ∙ Шани Ческис5 ∙ Вэйдун Лю1,3,4 ∙ Бинглей Ван2 ∙ Хунхуэй Чжу6 ∙ Лотте Ю. Пронк7 ∙ Марникс Х. Медема7 ∙ Ронни де Йонге8,9 ∙ Корне М.Дж. Питерс8 ∙ Асаф Леви5 ∙ Клаус Шлеппи10 ∙ Ян Бай2,3,12

Обложка этого выпуска Клетка представляет исследовательскую статью Доктор Ян Бай Пекинского университета под названием "Бактериальные и вирусные геномы корней сельскохозяйственных культур раскрывают неисследованные виды и закономерности микробиома”.

Предыстория исследования

Геномы микробов ризосферы необходимы для метагеномного анализа и изучения механизмов микробиомов ризосферы сельскохозяйственных культур. В настоящее время общедоступные геномы бактерий ризосферы сельскохозяйственных культур ограничены по количеству и филогенетическому разнообразию, а исследования бактериально-вирусных взаимодействий в экосистемах ризосферы сельскохозяйственных культур относительно недостаточны.

Значимость исследования

Расширение геномных ресурсов: путем объединения высокопроизводительной бактериальной культуры с метагеномным секвенированием были созданы коллекция бактериальных геномов ризосферы пшеницы, риса, кукурузы и люцерны (CRBC) и коллекция вирусных геномов (CRVC). CRBC значительно расширил количество и филогенетическое разнообразие общедоступных геномов бактерий ризосферы сельскохозяйственных культур, увеличив разнообразие бактерий ризосферы сельскохозяйственных культур на 290,6%; CRVC содержит 9736 не избыточных вирусных геномов, включая 1572 кластера на уровне рода, которые ранее не были зарегистрированы в микробиомах ризосферы сельскохозяйственных культур.

Открытие функций и взаимодействий: на основе этих геномов были идентифицированы консервативные бактериальные функции, которыми обогащены ризосферные микробиомы различных почв и растений-хозяев, а также были обнаружены ранее неизученные бактериально-вирусные взаимодействия в экосистемах ризосферы сельскохозяйственных культур.

Перспективы исследования

Исследование микробных механизмов: используйте CRBC и CRVC для глубокого изучения механизма взаимодействия микроорганизмов ризосферы сельскохозяйственных культур, например, того, как взаимодействие бактерий и вирусов влияет на структуру и функцию микробных сообществ ризосферы.

Исследование сельскохозяйственного применения: на основе этих геномных ресурсов разработать стратегии регулирования микроорганизмов ризосферы сельскохозяйственных культур для стимулирования роста и здоровья сельскохозяйственных культур, а также повышения устойчивости сельскохозяйственного производства, например, использование определенных ризосферных бактерий или вирусов для повышения устойчивости сельскохозяйственных культур к стрессу или способности усваивать питательные вещества.

Процесс разработки дизайна обложки

• Дизайн обложки вдохновлен темой микроорганизмов и вирусов, перекликаясь с исследовательским содержанием разнообразия ризосферных бактерий и вирусов в сельскохозяйственных культурах в статье. Центральная воронкообразная форма вихря символизирует сложность и разнообразие микробных сообществ, предполагая новые виды и модели микробиома, обнаруженные в исследовании.
• Общая цветовая комбинация свежая и естественная, с использованием темно-синего и фиолетового в качестве фонового цвета, что создает глубокую, таинственную и технологическую атмосферу. Зеленые и розовые изображения микробов выделяются на темном фоне, усиливая визуальное воздействие и привлекая внимание читателя.
• Общий стиль обложки тяготеет к научной фантастике и футуризму, сочетая абстрактные и образные элементы, как с художественной красотой, так и с научной строгостью. Использование линий и сеток усиливает ощущение технологии, символизируя сложность анализа данных и генных последовательностей, давая людям динамическое ощущение, как будто микроорганизмы постоянно движутся и изменяются, что делает это одновременно реальным и художественным. В конце концов, обложка получила высокую оценку учителей и редакторов журналов и была успешно опубликована!