Nucleic Acids Research
11 July 2022
Алгоритм трансформационной кластеризации и его применение для структурного профилирования полирибосом.
Wenhong Jiang1, Jonathan Wagner2,3, Wenjing Du1, Juergen Plitzko4, Wolfgang Baumeister2, Florian Beck4 and Qiang Guo1,5
1 Государственная ключевая лаборатория исследований белков и генов растений, Центр наук о жизни Пекин-Цинхуа, Академия перспективных междисциплинарных исследований, Школа наук о жизни, Пекинский университет, Пекин 100871, Китай,
2 Отдел структурной молекулярной биологии, Институт биохимии Макса Планка, Am Klopferspitz 18, 82152 Мартинсрид, Германия,
3 Отделение клеточной биохимии, Институт биохимии Макса Планка, Am Klopferspitz 18, 82152 Мартинсрид, Германия,
4 CryoEM Technology, Институт биохимии Макса Планка, Am Klopferspitz 18, 82152 Мартинсрид, Германия,
5 Лаборатория Чангпин, Пекин, Китай
10.1093/нар/gkac547
Усовершенствования в подготовке образцов для криоэлектронной томографии, приборах электронной микроскопии и алгоритмах обработки изображений продвинули вперед структурный анализ макромолекул in situ. Помимо такого анализа отдельных макромолекул, фундаментальное значение в биологии имеет изучение их взаимодействия с функционально связанными соседями в густонаселенных клеточных средах, т.е. «молекулярная социология». Здесь мы представляем алгоритм кластеризации топологии соседних молекул (NEMO-TOC). Мы оптимизировали этот алгоритм для обнаружения и профилирования полирибосом, которые играют как конститутивную, так и регуляторную роль в экспрессии генов. Наши результаты предполагают модель, в которой полисомы образуются путем соединения нескольких нестохастических блоков, в которой трансляция, вероятно, синхронизирована.
Anhui Province Academy of Science and Technology, No. 128,Wanshui Road, Hi-Tech Zone, Hefei City, Anhui Province, China
+86 17354022649
service@sondii.com
IPv6 ПОДДЕРЖИВАЕМАЯ СЕТЬ
Наши часы
Пн, 21 ноября – Ср, 23 ноября: 9:00 – 20:00.
Чт, 24.11: закрыто. С Днем Благодарения!
Пт, 25 ноября: 8:00–22:00.
Сб 26.11 – Вс 27.11: 10:00 – 21:00
(все часы указаны по восточному времени)
