Genetics and Genomics Служба дизайна обложек журналов (GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

Геномный и транскриптомный анализы позволяют идентифицировать важные гены, связанные с отложением подкожного жира у коров голштинской породы.

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

Основные цели этого исследования — идентифицировать ключевые гены-кандидаты, регулирующие отложение подкожного жира у высокопродуктивных молочных коров, путем интеграции наборов геномных и транскриптомных данных. В общей сложности 1654 генотипированных коров голштинской породы использовались для проведения полногеномного исследования ассоциаций (GWAS), направленного на идентификацию генов, связанных с отложением подкожного жира. Впоследствии проводится анализ сети взвешенной коэкспрессии генов (WGCNA) на основе данных секвенирования РНК 34 коров и отклонений продуктивности коров по отложению подкожного жира. Наконец, дифференциально экспрессируемые (DE) мРНК, днРНК и гены дифференциально альтернативного сплайсинга получены для 12 коров голштинской породы с крайними и расходящимися фенотипами отложения подкожного жира. Учитывая все результаты, гены NID2, STARD3, UFC1, DEDD, PPP1R1B и USP21 считаются наиболее важными генами-кандидатами, влияющими на особенности отложения подкожного жира у коров голштинской породы.